Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Liat1Q810M6 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms