Protein–RNA interactions for Protein: Q810L4

Tmem39b, Transmembrane protein 39B, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39bQ810L4 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem39bQ810L4 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem39bQ810L4 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem39bQ810L4 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem39bQ810L4 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem39bQ810L4 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem39bQ810L4 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem39bQ810L4 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem39bQ810L4 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem39bQ810L4 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem39bQ810L4 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem39bQ810L4 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem39bQ810L4 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem39bQ810L4 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem39bQ810L4 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem39bQ810L4 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem39bQ810L4 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem39bQ810L4 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem39bQ810L4 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem39bQ810L4 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem39bQ810L4 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem39bQ810L4 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem39bQ810L4 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem39bQ810L4 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem39bQ810L4 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem39bQ810L4 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem39bQ810L4 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem39bQ810L4 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem39bQ810L4 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Tmem39bQ810L4 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem39bQ810L4 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem39bQ810L4 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem39bQ810L4 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem39bQ810L4 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem39bQ810L4 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem39bQ810L4 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem39bQ810L4 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem39bQ810L4 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem39bQ810L4 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem39bQ810L4 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem39bQ810L4 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem39bQ810L4 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem39bQ810L4 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem39bQ810L4 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem39bQ810L4 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem39bQ810L4 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem39bQ810L4 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem39bQ810L4 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem39bQ810L4 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem39bQ810L4 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem39bQ810L4 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem39bQ810L4 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem39bQ810L4 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem39bQ810L4 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem39bQ810L4 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem39bQ810L4 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem39bQ810L4 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem39bQ810L4 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem39bQ810L4 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem39bQ810L4 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem39bQ810L4 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem39bQ810L4 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem39bQ810L4 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem39bQ810L4 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem39bQ810L4 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem39bQ810L4 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem39bQ810L4 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem39bQ810L4 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem39bQ810L4 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem39bQ810L4 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem39bQ810L4 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem39bQ810L4 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem39bQ810L4 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem39bQ810L4 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem39bQ810L4 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem39bQ810L4 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem39bQ810L4 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem39bQ810L4 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem39bQ810L4 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem39bQ810L4 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem39bQ810L4 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem39bQ810L4 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem39bQ810L4 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem39bQ810L4 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem39bQ810L4 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem39bQ810L4 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem39bQ810L4 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem39bQ810L4 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem39bQ810L4 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem39bQ810L4 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem39bQ810L4 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem39bQ810L4 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem39bQ810L4 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem39bQ810L4 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem39bQ810L4 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem39bQ810L4 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem39bQ810L4 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem39bQ810L4 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem39bQ810L4 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem39bQ810L4 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms