Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Krt40Q6IFX3 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Krt40Q6IFX3 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms