Protein–RNA interactions for Protein: Q6BCL1

Pram1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pram1Q6BCL1 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms