Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms