Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Gm30655-201ENSMUST00000220498 1383 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Gm37082-201ENSMUST00000192629 1927 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Acss2os-201ENSMUST00000148685 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 CT025525.2-201ENSMUST00000227743 423 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Gm44975-201ENSMUST00000207435 1390 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Ms4a5-202ENSMUST00000186937 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Ss18l2-205ENSMUST00000215833 479 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 AC160060.2-201ENSMUST00000220151 811 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Pate4-201ENSMUST00000034610 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Gm20541-201ENSMUST00000173035 1406 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms