Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
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CttnQ60598 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CttnQ60598 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CttnQ60598 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CttnQ60598 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CttnQ60598 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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CttnQ60598 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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CttnQ60598 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CttnQ60598 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
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CttnQ60598 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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CttnQ60598 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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CttnQ60598 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CttnQ60598 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CttnQ60598 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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