Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Spire1Q52KF3 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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