Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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