Protein–RNA interactions for Protein: Q497S0

Gm5935, EG546282 protein, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5935Q497S0 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5935Q497S0 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms