Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1V3

Esf1, ESF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Esf1Q3V1V3 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms