Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc110Q3V125 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc110Q3V125 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc110Q3V125 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms