Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Chpf2Q3UU43 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chpf2Q3UU43 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms