Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 AC136019.1-201ENSMUST00000226503 1412 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Olfr1281-201ENSMUST00000090326 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Gm14579-201ENSMUST00000117068 283 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Gm8190-201ENSMUST00000199603 586 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Gm4732-201ENSMUST00000118778 473 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Gm13505-201ENSMUST00000121666 817 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Gm16337-201ENSMUST00000160368 917 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Gm42516-201ENSMUST00000198691 767 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Vmn1r4-201ENSMUST00000096612 1034 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms