Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3UPC7 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3UPC7 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3UPC7 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3UPC7 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3UPC7 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3UPC7 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3UPC7 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3UPC7 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3UPC7 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3UPC7 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3UPC7 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3UPC7 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3UPC7 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3UPC7 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3UPC7 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3UPC7 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3UPC7 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3UPC7 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3UPC7 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3UPC7 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3UPC7 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3UPC7 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3UPC7 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3UPC7 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3UPC7 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3UPC7 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3UPC7 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3UPC7 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3UPC7 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3UPC7 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3UPC7 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3UPC7 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3UPC7 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3UPC7 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3UPC7 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3UPC7 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3UPC7 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3UPC7 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3UPC7 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3UPC7 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3UPC7 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3UPC7 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3UPC7 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3UPC7 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3UPC7 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3UPC7 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3UPC7 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3UPC7 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3UPC7 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3UPC7 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3UPC7 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3UPC7 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3UPC7 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3UPC7 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3UPC7 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3UPC7 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3UPC7 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3UPC7 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3UPC7 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3UPC7 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3UPC7 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3UPC7 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3UPC7 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3UPC7 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3UPC7 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3UPC7 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3UPC7 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3UPC7 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q3UPC7 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3UPC7 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3UPC7 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3UPC7 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3UPC7 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3UPC7 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3UPC7 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3UPC7 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3UPC7 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3UPC7 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3UPC7 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3UPC7 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3UPC7 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3UPC7 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3UPC7 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3UPC7 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3UPC7 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3UPC7 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3UPC7 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3UPC7 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3UPC7 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3UPC7 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3UPC7 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3UPC7 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3UPC7 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3UPC7 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3UPC7 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3UPC7 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3UPC7 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3UPC7 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3UPC7 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms