Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Tmem253Q3UNB8 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Tmem253Q3UNB8 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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Tmem253Q3UNB8 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms