Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Tbata-209ENSMUST00000148181 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc34Q3UI66 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc34Q3UI66 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc34Q3UI66 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc34Q3UI66 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc34Q3UI66 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc34Q3UI66 4930550C14Rik-204ENSMUST00000217318 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc34Q3UI66 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc34Q3UI66 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc34Q3UI66 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc34Q3UI66 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc34Q3UI66 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc34Q3UI66 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc34Q3UI66 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc34Q3UI66 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc34Q3UI66 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc34Q3UI66 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc34Q3UI66 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc34Q3UI66 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc34Q3UI66 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc34Q3UI66 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc34Q3UI66 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc34Q3UI66 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms