Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U595 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U595 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U595 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U595 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U595 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U595 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U595 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U595 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U595 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U595 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U595 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U595 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U595 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U595 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U595 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U595 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U595 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U595 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U595 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U595 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U595 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U595 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U595 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U595 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U595 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U595 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U595 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U595 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U595 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U595 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U595 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U595 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U595 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U595 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U595 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U595 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U595 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U595 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U595 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U595 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U595 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U595 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U595 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U595 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U595 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U595 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U595 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U595 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U595 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U595 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U595 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U595 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U595 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U595 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U595 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U595 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U595 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U595 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U595 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U595 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U595 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U595 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U595 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U595 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U595 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U595 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U595 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U595 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U595 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U595 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U595 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U595 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U595 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U595 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U595 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U595 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U595 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U595 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U595 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U595 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U595 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U595 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U595 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U595 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U595 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U595 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U595 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U595 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U595 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U595 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U595 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U595 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U595 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U595 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U595 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U595 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U595 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U595 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q3U595 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms