Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms