Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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