Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms