Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Rpusd3Q14AI6 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Rpusd3Q14AI6 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
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