Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
MitfQ08874 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
MitfQ08874 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MitfQ08874 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MitfQ08874 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MitfQ08874 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
MitfQ08874 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MitfQ08874 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MitfQ08874 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MitfQ08874 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MitfQ08874 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
MitfQ08874 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
MitfQ08874 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.3 ms