Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms