Protein–RNA interactions for Protein: Q03142

Fgfr4, Fibroblast growth factor receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr4Q03142 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fgfr4Q03142 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms