Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctnnb1Q02248 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctnnb1Q02248 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctnnb1Q02248 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctnnb1Q02248 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctnnb1Q02248 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctnnb1Q02248 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctnnb1Q02248 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctnnb1Q02248 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctnnb1Q02248 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctnnb1Q02248 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctnnb1Q02248 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctnnb1Q02248 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctnnb1Q02248 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctnnb1Q02248 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctnnb1Q02248 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctnnb1Q02248 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctnnb1Q02248 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ctnnb1Q02248 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ctnnb1Q02248 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ctnnb1Q02248 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ctnnb1Q02248 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ctnnb1Q02248 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ctnnb1Q02248 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ctnnb1Q02248 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ctnnb1Q02248 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ctnnb1Q02248 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ctnnb1Q02248 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctnnb1Q02248 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctnnb1Q02248 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctnnb1Q02248 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctnnb1Q02248 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctnnb1Q02248 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctnnb1Q02248 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctnnb1Q02248 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctnnb1Q02248 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctnnb1Q02248 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctnnb1Q02248 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctnnb1Q02248 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctnnb1Q02248 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctnnb1Q02248 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctnnb1Q02248 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctnnb1Q02248 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctnnb1Q02248 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctnnb1Q02248 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctnnb1Q02248 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctnnb1Q02248 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctnnb1Q02248 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctnnb1Q02248 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctnnb1Q02248 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctnnb1Q02248 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctnnb1Q02248 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctnnb1Q02248 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctnnb1Q02248 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctnnb1Q02248 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctnnb1Q02248 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctnnb1Q02248 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctnnb1Q02248 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctnnb1Q02248 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctnnb1Q02248 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctnnb1Q02248 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctnnb1Q02248 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctnnb1Q02248 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctnnb1Q02248 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctnnb1Q02248 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctnnb1Q02248 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctnnb1Q02248 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctnnb1Q02248 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctnnb1Q02248 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctnnb1Q02248 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctnnb1Q02248 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctnnb1Q02248 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctnnb1Q02248 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctnnb1Q02248 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctnnb1Q02248 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctnnb1Q02248 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctnnb1Q02248 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctnnb1Q02248 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctnnb1Q02248 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctnnb1Q02248 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctnnb1Q02248 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctnnb1Q02248 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctnnb1Q02248 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctnnb1Q02248 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctnnb1Q02248 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctnnb1Q02248 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctnnb1Q02248 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctnnb1Q02248 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctnnb1Q02248 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctnnb1Q02248 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctnnb1Q02248 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctnnb1Q02248 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctnnb1Q02248 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctnnb1Q02248 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctnnb1Q02248 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctnnb1Q02248 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctnnb1Q02248 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctnnb1Q02248 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctnnb1Q02248 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctnnb1Q02248 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms