Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec23aQ01405 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.5 ms