Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms