Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SbdsP70122 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SbdsP70122 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SbdsP70122 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SbdsP70122 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SbdsP70122 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SbdsP70122 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SbdsP70122 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SbdsP70122 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SbdsP70122 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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