Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P58686 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P58686 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P58686 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P58686 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P58686 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P58686 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P58686 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P58686 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P58686 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P58686 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
P58686 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P58686 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P58686 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
P58686 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P58686 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P58686 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P58686 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P58686 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P58686 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P58686 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P58686 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P58686 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P58686 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P58686 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P58686 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P58686 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P58686 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P58686 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P58686 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P58686 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P58686 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P58686 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P58686 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P58686 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P58686 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P58686 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P58686 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P58686 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P58686 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P58686 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P58686 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P58686 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P58686 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P58686 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P58686 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P58686 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P58686 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P58686 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P58686 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P58686 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P58686 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P58686 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P58686 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P58686 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P58686 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P58686 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P58686 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P58686 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P58686 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P58686 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P58686 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P58686 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P58686 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
P58686 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P58686 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P58686 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P58686 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
P58686 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P58686 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P58686 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P58686 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P58686 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
P58686 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P58686 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P58686 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P58686 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P58686 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P58686 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P58686 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P58686 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P58686 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P58686 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P58686 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P58686 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P58686 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
P58686 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P58686 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P58686 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
P58686 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P58686 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P58686 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P58686 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P58686 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P58686 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P58686 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P58686 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P58686 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P58686 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P58686 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.5 ms