Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
VdrP48281 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VdrP48281 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VdrP48281 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VdrP48281 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
VdrP48281 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VdrP48281 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
VdrP48281 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
VdrP48281 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VdrP48281 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VdrP48281 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
VdrP48281 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
VdrP48281 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VdrP48281 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VdrP48281 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VdrP48281 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
VdrP48281 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VdrP48281 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
VdrP48281 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VdrP48281 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
VdrP48281 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
VdrP48281 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
VdrP48281 Gm37785-201ENSMUST00000195783 2408 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
VdrP48281 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VdrP48281 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VdrP48281 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VdrP48281 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
VdrP48281 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
VdrP48281 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VdrP48281 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
VdrP48281 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
VdrP48281 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
VdrP48281 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
VdrP48281 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
VdrP48281 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
VdrP48281 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
VdrP48281 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VdrP48281 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VdrP48281 Gm11685-201ENSMUST00000141559 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VdrP48281 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VdrP48281 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VdrP48281 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VdrP48281 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VdrP48281 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
VdrP48281 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VdrP48281 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
VdrP48281 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VdrP48281 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VdrP48281 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VdrP48281 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VdrP48281 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VdrP48281 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VdrP48281 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
VdrP48281 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VdrP48281 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VdrP48281 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VdrP48281 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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VdrP48281 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VdrP48281 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VdrP48281 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VdrP48281 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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VdrP48281 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VdrP48281 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VdrP48281 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC13□□□□□ -0.33
VdrP48281 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VdrP48281 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VdrP48281 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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VdrP48281 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VdrP48281 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VdrP48281 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
VdrP48281 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VdrP48281 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VdrP48281 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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VdrP48281 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VdrP48281 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
VdrP48281 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VdrP48281 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VdrP48281 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VdrP48281 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VdrP48281 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VdrP48281 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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