Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtbP41155 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtbP41155 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtbP41155 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtbP41155 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtbP41155 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtbP41155 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtbP41155 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LtbP41155 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LtbP41155 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LtbP41155 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LtbP41155 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LtbP41155 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LtbP41155 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LtbP41155 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LtbP41155 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LtbP41155 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LtbP41155 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LtbP41155 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LtbP41155 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LtbP41155 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LtbP41155 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LtbP41155 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LtbP41155 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LtbP41155 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LtbP41155 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LtbP41155 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LtbP41155 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
LtbP41155 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
LtbP41155 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LtbP41155 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
LtbP41155 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LtbP41155 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LtbP41155 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
LtbP41155 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LtbP41155 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LtbP41155 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LtbP41155 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LtbP41155 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LtbP41155 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LtbP41155 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LtbP41155 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LtbP41155 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LtbP41155 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LtbP41155 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LtbP41155 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LtbP41155 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
LtbP41155 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LtbP41155 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
LtbP41155 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
LtbP41155 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
LtbP41155 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
LtbP41155 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
LtbP41155 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
LtbP41155 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
LtbP41155 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
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LtbP41155 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
LtbP41155 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
LtbP41155 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LtbP41155 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LtbP41155 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LtbP41155 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LtbP41155 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LtbP41155 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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LtbP41155 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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LtbP41155 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LtbP41155 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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LtbP41155 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LtbP41155 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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LtbP41155 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LtbP41155 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LtbP41155 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LtbP41155 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LtbP41155 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LtbP41155 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LtbP41155 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LtbP41155 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LtbP41155 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LtbP41155 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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