Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TtlP38585 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TtlP38585 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TtlP38585 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TtlP38585 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TtlP38585 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TtlP38585 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TtlP38585 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TtlP38585 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TtlP38585 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TtlP38585 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TtlP38585 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TtlP38585 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
TtlP38585 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
TtlP38585 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TtlP38585 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TtlP38585 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TtlP38585 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TtlP38585 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TtlP38585 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TtlP38585 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TtlP38585 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TtlP38585 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TtlP38585 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TtlP38585 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
TtlP38585 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TtlP38585 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TtlP38585 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TtlP38585 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
TtlP38585 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
TtlP38585 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TtlP38585 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
TtlP38585 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TtlP38585 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
TtlP38585 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
TtlP38585 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TtlP38585 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TtlP38585 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TtlP38585 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TtlP38585 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TtlP38585 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TtlP38585 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TtlP38585 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
TtlP38585 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
TtlP38585 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
TtlP38585 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
TtlP38585 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
TtlP38585 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
TtlP38585 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TtlP38585 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TtlP38585 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TtlP38585 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TtlP38585 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TtlP38585 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TtlP38585 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TtlP38585 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TtlP38585 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TtlP38585 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TtlP38585 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TtlP38585 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TtlP38585 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TtlP38585 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TtlP38585 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TtlP38585 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
TtlP38585 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TtlP38585 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TtlP38585 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TtlP38585 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TtlP38585 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TtlP38585 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
TtlP38585 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TtlP38585 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TtlP38585 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TtlP38585 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
TtlP38585 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
TtlP38585 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TtlP38585 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TtlP38585 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TtlP38585 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TtlP38585 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TtlP38585 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TtlP38585 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TtlP38585 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TtlP38585 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TtlP38585 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
TtlP38585 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
TtlP38585 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TtlP38585 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TtlP38585 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TtlP38585 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TtlP38585 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TtlP38585 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TtlP38585 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TtlP38585 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TtlP38585 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TtlP38585 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TtlP38585 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TtlP38585 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TtlP38585 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TtlP38585 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms