Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rom1P32958 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rom1P32958 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rom1P32958 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rom1P32958 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Rom1P32958 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rom1P32958 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Rom1P32958 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rom1P32958 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Rom1P32958 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Rom1P32958 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Rom1P32958 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Rom1P32958 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Rom1P32958 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rom1P32958 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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