Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ChgaP26339 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChgaP26339 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Gm5708-201ENSMUST00000196289 886 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChgaP26339 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms