Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkchP23298 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkchP23298 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkchP23298 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkchP23298 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkchP23298 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkchP23298 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkchP23298 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkchP23298 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkchP23298 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms