Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PparaP23204 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
PparaP23204 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PparaP23204 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PparaP23204 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PparaP23204 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PparaP23204 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PparaP23204 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PparaP23204 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PparaP23204 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PparaP23204 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PparaP23204 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PparaP23204 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PparaP23204 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
PparaP23204 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PparaP23204 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PparaP23204 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PparaP23204 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PparaP23204 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PparaP23204 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PparaP23204 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PparaP23204 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PparaP23204 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PparaP23204 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
PparaP23204 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PparaP23204 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PparaP23204 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PparaP23204 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PparaP23204 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PparaP23204 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PparaP23204 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
PparaP23204 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PparaP23204 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
PparaP23204 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
PparaP23204 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
PparaP23204 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PparaP23204 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
PparaP23204 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PparaP23204 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PparaP23204 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PparaP23204 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PparaP23204 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PparaP23204 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
PparaP23204 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PparaP23204 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PparaP23204 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PparaP23204 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PparaP23204 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PparaP23204 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PparaP23204 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PparaP23204 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PparaP23204 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
PparaP23204 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PparaP23204 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PparaP23204 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PparaP23204 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PparaP23204 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PparaP23204 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PparaP23204 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PparaP23204 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PparaP23204 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PparaP23204 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PparaP23204 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PparaP23204 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PparaP23204 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PparaP23204 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PparaP23204 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PparaP23204 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PparaP23204 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PparaP23204 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PparaP23204 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PparaP23204 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PparaP23204 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PparaP23204 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PparaP23204 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PparaP23204 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PparaP23204 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PparaP23204 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PparaP23204 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PparaP23204 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PparaP23204 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PparaP23204 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PparaP23204 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PparaP23204 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PparaP23204 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PparaP23204 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PparaP23204 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PparaP23204 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PparaP23204 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PparaP23204 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PparaP23204 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PparaP23204 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PparaP23204 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PparaP23204 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PparaP23204 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PparaP23204 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PparaP23204 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PparaP23204 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PparaP23204 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PparaP23204 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms