Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spi1P17433 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spi1P17433 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spi1P17433 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Spi1P17433 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Spi1P17433 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms