Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gabra6P16305 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gabra6P16305 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gabra6P16305 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gabra6P16305 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gabra6P16305 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gabra6P16305 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gabra6P16305 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gabra6P16305 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gabra6P16305 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gabra6P16305 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gabra6P16305 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gabra6P16305 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gabra6P16305 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gabra6P16305 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gabra6P16305 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gabra6P16305 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gabra6P16305 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gabra6P16305 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gabra6P16305 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gabra6P16305 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gabra6P16305 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gabra6P16305 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gabra6P16305 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gabra6P16305 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gabra6P16305 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gabra6P16305 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gabra6P16305 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gabra6P16305 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gabra6P16305 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gabra6P16305 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gabra6P16305 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gabra6P16305 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gabra6P16305 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gabra6P16305 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gabra6P16305 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gabra6P16305 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gabra6P16305 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gabra6P16305 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gabra6P16305 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gabra6P16305 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gabra6P16305 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gabra6P16305 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gabra6P16305 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gabra6P16305 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gabra6P16305 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gabra6P16305 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gabra6P16305 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gabra6P16305 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gabra6P16305 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gabra6P16305 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gabra6P16305 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gabra6P16305 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gabra6P16305 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gabra6P16305 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms