Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prf1P10820 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prf1P10820 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Prf1P10820 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prf1P10820 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prf1P10820 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prf1P10820 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Prf1P10820 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prf1P10820 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Prf1P10820 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms