Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms