Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

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Length 400 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Foxq1O70220 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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