Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nek2O35942 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek2O35942 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek2O35942 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek2O35942 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek2O35942 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek2O35942 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek2O35942 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek2O35942 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek2O35942 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek2O35942 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Nek2O35942 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Nek2O35942 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms