Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Kcns1O35173 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Kcns1O35173 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Kcns1O35173 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Kcns1O35173 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
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