Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms