Protein–RNA interactions for Protein: J3QP01

Gm5108, Predicted gene 5108, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5108J3QP01 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm5108J3QP01 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5108J3QP01 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5108J3QP01 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5108J3QP01 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5108J3QP01 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.6 ms