Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.1 ms