Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

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Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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