Protein–RNA interactions for Protein: F6V0H0

Pagr1b, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1B (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1bF6V0H0 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pagr1bF6V0H0 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pagr1bF6V0H0 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pagr1bF6V0H0 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pagr1bF6V0H0 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pagr1bF6V0H0 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pagr1bF6V0H0 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pagr1bF6V0H0 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pagr1bF6V0H0 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pagr1bF6V0H0 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pagr1bF6V0H0 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pagr1bF6V0H0 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pagr1bF6V0H0 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pagr1bF6V0H0 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pagr1bF6V0H0 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pagr1bF6V0H0 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pagr1bF6V0H0 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pagr1bF6V0H0 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pagr1bF6V0H0 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pagr1bF6V0H0 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pagr1bF6V0H0 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pagr1bF6V0H0 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pagr1bF6V0H0 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pagr1bF6V0H0 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pagr1bF6V0H0 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pagr1bF6V0H0 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pagr1bF6V0H0 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pagr1bF6V0H0 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pagr1bF6V0H0 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pagr1bF6V0H0 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pagr1bF6V0H0 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pagr1bF6V0H0 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pagr1bF6V0H0 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pagr1bF6V0H0 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pagr1bF6V0H0 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pagr1bF6V0H0 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pagr1bF6V0H0 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pagr1bF6V0H0 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pagr1bF6V0H0 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pagr1bF6V0H0 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pagr1bF6V0H0 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pagr1bF6V0H0 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pagr1bF6V0H0 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pagr1bF6V0H0 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pagr1bF6V0H0 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pagr1bF6V0H0 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pagr1bF6V0H0 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pagr1bF6V0H0 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms