Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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